La FIEIDE mantiene excelentes relaciones de colaboración con un buen número de misiones extranjeras que han venido a trabajar en nuestro país. Hay más de 40 familias (o personas solteras), pertenecientes a un total de 15 misiones colaboradoras, que están vinculadas a alguna iglesia federada, y que realizan trabajos en diversos ministerios. Comenzando en 2003 se ha establecido un plan para poder tener bianualmente un encuentro con todos los misioneros que colaboran con la FIEIDE y también bianualmente en años alternos un encuentro con los encargados de misión. Uno de los proyectos en los que se está trabando es la elaboración de un plan conjunto para la fundación de nuevas iglesias en España. El borrador de este manual fue presentado en el último retiro con directores de misiones en noviembre 2006. Con las aportaciones del retiro se quiere hacer la primera edición próximamente.
- Allianz Mission
- Avant Ministries
- Baptist Missions (Irlanda)
- CrossWorld
- Evangelical Covenant Church Mission (USA)
- EFCA-IM (Evangelical Free Church of America)
- Marburger Misión
- Misión Cristiana Europea
- Misión Evangélica Española
- OM (Operación Movilización)
- TEAM (The Evangelical Alliance Mission)
- Tentmakers Bible Mission
- UFM Worldwide
- Visión Europa
- WorldVenture (antes CBInternational)